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Después de la Segunda Guerra Mundial, el club volvió a formar parte de las ligas superiores en la Oberliga Südwest de Alemania, pero nunca superó la mitad de la tabla. Se retiró durante un tiempo -desde finales de los años 70 hasta finales de los a la Oberliga Südwest III , como consecuencia de una serie de problemas financieros. El Maguncia se proclamó campeón de Alemania amateur en Bundesliga por una sola temporada en con Bodo Hertlein como presidente, antes de regresar finalmente para una carrera prolongada en Al principio, el equipo era un eterno candidato al descenso, y luchaba cada temporada por evitarlo.

Un año antes, el Maguncia se convirtió en el mejor equipo no ascendido de todos los tiempos en la 2. Bundesliga, con 64 puntos acumulados. Sin embargo, la perseverancia del club dio sus frutos tras el ascenso a la Bundesliga en bajo la dirección de Jürgen Klopp. En la temporada , el Maguncia igualó el récord de inicio de la Bundesliga al ganar sus siete primeros partidos de esa temporada. FC Kaiserslautern. Los partidos contra el 1. FC Kaiserslautern se consideran el "derbi de Renania-Palatinado" y son los derbis con mayor prioridad para parte de la afición del Mainz.